AlphaFold

AlphaFold to system sztucznej inteligencji opracowany przez Google DeepMind do przewidywania trojwymiarowej struktury bialek na podstawie sekwencji aminokwasow. Uwazany jest za jeden z najwazniejszych przelomow AI w naukach przyrodniczych: AlphaFold 2 (2020) wygral konkurs CASP14 z dokladnoscia porownywalna z metodami eksperymentalnymi, a wyniki opublikowano w Nature w lipcu 2021 r. Za przewidywanie struktury bialek Demis Hassabis i John Jumper otrzymali polowe Nagrody Nobla w dziedzinie chemii w 2024 r.

Jako gotowy produkt AlphaFold udostepniany jest w dwoch glownych formach. AlphaFold Protein Structure Database (AlphaFold DB), prowadzona wspolnie z EMBL-EBI i uruchomiona 22 lipca 2021 r., zawiera ponad 200 milionow przewidzianych struktur bialek (od 2022 r.) i jest bezplatnie dostepna na licencji CC-BY 4.0. AlphaFold Server (2024) to darmowe narzedzie webowe pozwalajace naukowcom uruchamiac predykcje modelu AlphaFold 3 do zastosowan niekomercyjnych.

AlphaFold 3, ogloszony 8 maja 2024 r. i wspolrozwijany z Isomorphic Labs, rozszerza mozliwosci poza pojedyncze bialka - przewiduje struktury kompleksow bialek z DNA, RNA, ligandami i jonami, z istotna poprawa dokladnosci interakcji bialko-czasteczka. System jest szeroko wykorzystywany w biologii strukturalnej, bioinformatyce, badaniach nad przeciwcialami i odkrywaniu lekow.